Năm 1994, một phần diện tích và dân số của xã Trường Thủy được tách ra để thành lập xã Văn Thủy.[3]

Trước khi sáp nhập, xã Trường Thủy có diện tích 20,46 km², dân số là 1.652 người, mật độ dân số đạt 81 người/km², có 9 thôn: Đại Thủy, Cồn Thi, Hồng Giang, Hương Thủy, Lục Giang, Lục Sơn, Kim Tiền, Long Thủy, Vườn Hoa. Xã Văn Thủy có diện tích 15,18 km², dân số là 2.828 người, mật độ dân số đạt 187 người/km², có 7 thôn: Ba Canh, Trạng Cau, Xuân Giang, Đông Xuân, Việt Xô, Tiến Giang, Văn Minh.

Ngày 10 tháng 1 năm 2020, Ủy ban Thường vụ Quốc hội ban hành Nghị quyết số 862/NQ-UBTVQH14 về việc sắp xếp các đơn vị hành chính cấp xã thuộc tỉnh Quảng Bình (nghị quyết có hiệu lực từ ngày 1 tháng 2 năm 2020)[2]. Theo đó, sáp nhập toàn bộ diện tích và dân số của xã Văn Thủy trở lại xã Trường Thủy.